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Illumina响应国网中心科技抗疫 提供新冠病毒基因定序分析服务

为协助台湾应付新一波疫情对公卫、民生、经济、教育等面向之冲击与挑战,科技部辖下的国家实验研究院国家高速网络与计算中心(国研院国网中心)于本(6)月初甫启动科技抗疫2.0专案 ,释出台湾杉系列超级电脑算力、储存、大数据数据集及DAS数据分析平台等资源,免费开放各界提案申请运用抗击疫情。

6月21日更进一步宣布,与全球基因定序的领导者Illumina 携手,提供专案申请者新型冠状病毒(SARS-CoV-2)病毒基因定序分析服务(COVIDSeq),定序样本数量无限制,且可以无偿使用至2021年12月31日,以透过分析病毒的基因定序数据,进行病毒监测、传播链溯源,甚至用于疫苗开发研究。

次时代基因定序 是迈向新一代精准医疗或精准健康所需的关键核心技术,此技术不仅可用于人体及其他生物,也可用于病毒基因体的解码。2020年初COVID-19(新冠肺炎)爆发初期,第一个SARS-CoV-2病毒基因体即由 Illumina定序解密,使厂商得以快速开发核酸检测(PCR)及mRNA疫苗。

基因定序也是溯源检测的一大利器,藉由分析完整的病毒基因图谱,有助基因序列比对,确认感染者之间的关联性,并可以观察是否有新的病毒株产生,找出新的突变位点。

在科技抗疫2.0专案中,国研院国网中心提供的高速基因序列分析设备及平台运算环境,辅以Illumina提供的COVIDSeq免费分析流量,可支持台湾各大基因定序实验室、基因体中心、产业界,一天最高处理6,000多个检体,让检体基因定序的研究量能大幅提升,为疫调分析、病毒演化或疫苗开发提供科学上的证据及助益。

科技部吴政忠部长表示,对抗疫情不分国界,Illumina是国际指标性的基因定序技术领导者,科技部引进国际资源,促进公私协力,期以科技共同助力台湾抗疫工作。国研院国网中心史晓斌主任表示,Illumina的加入为台湾研究病毒基因定序分析工作带来强力奥援,透过超级电脑快速进行病毒分析,将为台湾带来更大抗击新冠疫情的能量来应对病毒变异之威胁。

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