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大数据平台建置越发完善 疾管署图象化预测当月趋势

卫生福利部疾病管制署自2018年起,由内部人员主导及实作,自行建置以开源软件为基础之资料加值服务器系统。系统使用多种免费和开源工具汇集而成。卫生福利部疾病管制署疫情中心主任刘定萍说,透过与研发替代役与各领域人员的合作,疾管署的数据分析能力已经越来越完整。目前除了能够图象化分析近4周内的疾病趋势以外,更与许多公私单位都有密切数据平台合作。

卫生福利部疾病管制署疫情中心主任刘定萍认为,数据分析平台提供更好的视觉化疾病防治效果。蔡腾辉摄

疾管署使用了开源资料库-PostgreSQL,进行资料前置处理与其它系统资料库的对接,并建立RStudio-Server与JupyterHub作为资料分析和视觉化的程序设计编译工具。此外,也提供内部资料加值同仁进行专案开发,并透过Shiny-Server作为最后视觉化面板的呈现。更持续透过集成工具Jenkins让程序自动化编译与测试,进而达到自动化检查专案状态的目的。开源的博客系统Hexo则作为文件编译使用。

系统汇整了法定传染病通报及检验资料、急诊就诊资料、健保资料、实验室通报资料、定医通报资料、学校传染病资料等多项署内外资料,后续透过信件、Shiny面板、PowerBI面板、档案同步、EXCEL自动化更新报表、资料库等方式供业务加值使用。

疾管署资料加值平台架构。疾管署提供

Shiny面板画面。疾管署提供

刘定萍说,现在已经能够透过系统,预测流感疫情发生的时间与区域。疾管署现在的流感预测已能够有精细到全台六大区域及乡镇县市。不过疾管署现阶段主要是聚焦在「短期的人数预测」,所以主要是针对未来4周的流感疫情变化预测。更长期的流感疫情预测,就需要之后再发展更多其它的模型。

刘定萍说,台湾大企业的社会责任感都很强,都很愿意和公私部门合作。不过,医疗与疾病防治都还是要先了解资通讯产业有何技术,才知道有何么样的方向可以切入、共同配合。目前都是以专案的方式,进行一些公共卫生疾病管制的计划。包括与台湾人工智能学校合作。透过出题目让人工智能学校的成员来解答的方式,彼此交流。。也希望让同仁在Python与R领域上继续钻研与学习。未来能够降低程序语言的门槛,让疾病防治的专业度再次提升。

在登革热的防治上,现在可以已经可以预估数量和次数。象是2016年就与IBM共同合作,在预测模型当中,可以知道透过释放特定公蚊,让有疫情的的母蚊无法繁衍后代的方式,来防治登革热。刘定萍说,国家卫生研究院与环保署正在研议修法,未来将评估释放。

刘定萍表示,目前透过政府社群与信息产业社群等两方面宣达疾管署的事务内容。在各级行政会议的政府社群当中,疾管署为了提升技术应用在专业领域的能见度,常常参与公共卫生年会等专业研讨会,发表相关研发成果。此外,希望导入外部技术资源与提供传染病防治上的应用情境及所需资料,也与外部单位缔结合作研究关系,希望透过建立良好的公私协力合作模式,引导相关产业发现传染病应用人工智能等新兴科技的潜力及开发价值。进而补足信息及技术落差。包括了行政院、国发会信息处、中央与地方的会议,疾管署都有参与,并且分享在产业中的实作心得。

另外一类的信息业社群,则包括媒体记者会、指标企业、合作案新闻露出、相关业者合作、台湾计算机公会成果分享、流感预报站、LINE@疾管家、防疫云疫病通报系统、Facebook-1922防疫达人、Instagram、LINE@、twitter等官方帐号

刘定萍说,未来可能在预算上,还需要特别规划,才有机会外聘专业信息人员,进而衔接未来研发替代役的空缺。此外,防疫与医疗虽然在核心发展面向有些不同。不过数据的转化仍旧类似。象是图象化的流感预报。民众就可以自主戴口罩、打疫苗,使得健康促进有成效。

虽然研发替代役在疾管署的技术成长虽然没有像在信息产业的那么快,但刘定萍表示,疾管署的研发替代役都多了一份社会责任与不同的技术努力方向。而疾管署也透过让研发替代役,独立与合作执行专案的方式,完成不少案子。让役男退役求职时,仍有不少成功的作品可以提供企业参考。

未来医事检验单位,或许能够将资料分享给医院。医院得知流行性疾病的种类与应注意的事项,就可以从民众卫教与院内防护做起,提升整体国民健康。

在大数据分析、人工智能、影像辨识等等多元技术发展快速的现代,刘定萍认为,如何应用技术很重要。除了希望未来实验室资料可以加入自动通报之列以外,AI加上电子病历,更能够达到自动化的成效。在检验端,若是检出病原体与相关符合症状,电子病历就会自动带出。

在疫情调查部分,也努力将病媒蚊调查与地方GIS系统结合。智能型手机定位蚊多的孳生源,各地方单位都建档。再集成AI的技术,可以提供中央与决策层级数据,进而给予第一线人员指令。

蔡腾辉

DIGITIMES电子时报智能医疗主编蔡腾辉Mark Tsai
专注研究智能医疗产品技术服务导入场域时,所遇到的困难症结与如何克服要点。
精通中英德语,热爱挑战与Swing Dance。
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