AWS助力科学家发现13万种RNA病毒 防堵全球传染病爆发

AWS助力科学家发现13万种RNA病毒，防堵全球传染病爆发。AWS

Amazon Web Services(AWS)宣布近期与加拿大哥伦比亚大学云端创新中心(UBC CIC)合作，以AWS云端科技为基础建构的超级运算平台，助力国际科学团队在短短11天内蒐集了近600万份公开可用的生物样本，成功识别超过13万种新型RNA病毒，其中包括9种新型冠状病毒。若使用一台传统电脑，需要费时2,000年才能完成。该专案实现了RNA病毒研究的另一创举，透过识别并溯源新型病毒，科学家们希望在病毒感染人、动物、农作物和濒危物种前，能尽早识别出病毒，帮助防范全球传染病大爆发。

在AWS的帮助下，UBC CIC团队和全球计算生物学家发起了The Open Virome(开放病毒专案)，并建立Serratus，一个开放性病毒侦测云端运算平台。目前该研究成果已经发表在科学杂志《Science》上，同时也创建了公开病毒数据库，向全球科学界分享研究成果，帮助加速对RNA病毒的研究。

由RNA病毒引起的疾病包含普通感冒、流行性感冒、严重急性呼吸道症候群(SARS)、COVID-19(新冠肺炎)、C型肝炎、伊波拉病毒、狂犬病、脊髓灰质炎(小儿麻痹症)和麻疹等。由于RNA病毒繁殖和进化速度快，因此更容易感染新的宿主物种。如果基因组学研究人员能够提前识别新冠病毒，将彻底改变当前全球疫情的状况。基于AWS服务所取得的研究成果，彻底改变了生物信息学的研究方式。在此之前，科学家们经过几十年的数据分析，只发现了1.5万种病毒。而在使用AWS的基础架构和服务后，The Open Virome专案团队在发现新病毒方面，已为科学界节省了数百万美元和长达数年的时间。

病毒的识别和研究需要分析海量的基因定序数据，其中就包括数十万种未知病毒的DNA和RNA。基因组学的数据量每天都以倍速增长，造成病毒定序数据库的总量非常庞大，依靠传统运算方式根本无法对其进行全面分析或处理。计算生物学家兼The Open Virome专案负责人Artem Babaian表示：「未来预防大流行病的关键是知识。现今的数据量远远超过我们所能处理的能力，我们拥有所需的一切信息，但却没有使用这些信息的工具。」

The Open Virome专案的研究人员仅用8周的时间，顺利地运用AWS的云端科技建构功能强大的超级运算平台。借助其优异且弹性的运算能力，快速处理数百万GB的数据，并获得显着成本效益。该团队运用Amazon Simple Storage Service(Amazon S3)中镜像出病毒基因定序数据库SRA，而后使用AWS弹性运算云端执行个体Amazon Elastic Compute Cloud(Amazon EC2)来分析数据集。专案团队的目标是在处理每个定序数据集支付不到1美分，而在专案完成时全面超越此目标，实际上在处理每个定序数据集支付不到半美分。

在短短11天内，该团队处理高达570万个定序数据集，仅花费2.4万美元，并发现了13万个新型RNA病毒。奠基于AWS云端科技打造的Serratus平台，研究人员相信他们既能识别潜在的有害新病毒，又能提醒科学家注意COVID-19(新冠肺炎)病毒SARS-CoV-2 virus的潜在突变成因，帮助改善诊断测试和疫苗开发，为医疗政策决策者提供更有效的指引。

医疗和生命科学产业是AWS的优势领域之一，透过在基因组学研究中应用云端运算，让客户能将更多时间和资源应用于科学研究，以更快获得洞察，并加速进行突破性研究和产品上市。AWS强大的运算和机器学习服务确保科学家可以快速执行工作，强大的运算能力且弹性的定价带来高性价比，同时遍布全球的基础设施和统一架构，以及托管超过40个开放的生命科学和基因组数据集，实现在全球展开安全的研究协作。